Στον προσδιορισμό των προτεραιοτήτων στις οποίες επικεντρώνονται οι επενδύσεις δίνει βάρος με νέα εργαλεία η Περιφέρεια Θεσσαλίας. Ο προσδιορισμός αυτός βασίζεται στην ανάλυση των δυνατών σημείων και του δυναμικού της Θεσσαλικής οικονομίας και στη διαδικασίας στήριξης των επιχειρήσεων.
Η διαδικασία στήριξης είναι μία διαδικασία προσδιορισμού και εξειδίκευσης των προτεραιοτήτων «από τα κάτω», στην οποία συμμετέχουν οι φορείς του τετραπλού αναπτυξιακού «έλικα» και ειδικότερα επιχειρήσεις, ερευνητικά κέντρα και πανεπιστήμια, δημόσιος τομέας και εκπρόσωποι της κοινωνίας των πολιτών.
Η δραστηριότητα του Περιφερειακού Μηχανισμού δεν αφορά σε παροχή υπηρεσιών σε επιχειρήσεις. Η δομή λειτουργεί υποστηρικτικά προς το σύνολο του συστήματος καινοτομίας και επιχειρηματικότητας της Περιφέρειας Θεσσαλίας.
Σκοπός της δράσης είναι η ενίσχυση της εξωστρέφειας του ερευνητικού και παραγωγικού συστήματος της Περιφέρειας και της ανάπτυξης κουλτούρας καινοτομίας στις επιχειρήσεις, η υποστήριξη υφιστάμενων και νέων επιχειρήσεων για την υλοποίηση έργων έρευνας και καινοτομίας σε συνεργασία με άλλες επιχειρήσεις ή ερευνητικούς φορείς, η δημιουργία προϋποθέσεων για την ενεργοποίηση συστάδων επιχειρηματικών-ερευνητικών δραστηριοτήτων και η σύνδεση του παραγωγικού συστήματος με ερευνητικούς φορείς.